原子間にひく線の設定
[Ball and Sticks]を選んだときに表示される、原子間の線の引き方について説明します。
原子間結合の設定画面
- メニューから[Edit]-[Bonds…]を選び、上記の設定画面を表示させます。
- 画面下部の [1 XX XX …] と書いてある行を一度クリックして[選択]します。
[Max. length]に、線を引きたい距離より少し大きい値を入れます。
([Min. length]以上、[Max. length]以下の距離の原子の間に線が引かれる)
例えば、距離2.48 Å の原子対の間に線を引きたいときは
[Min. length] = 0, [Max. length] = 2.5 とします。 - [Apply]ボタン(または[OK]ボタン)を押します。
線を消したい場合は[Max length]に元の値を入れ、(初期値は1.601) [Apply]を押します。
他
- 特定の種類の原子の間に結合を引きたい場合、
[Search A2 bonded to A1]を選んで、[A1]と[A2]に原子種を設定し、[Min. length]と[Max. length]に原子間距離の最小値と最大値を入力し、[Apply]を押すと、指定した範囲内の距離に結合が引かれる。 - 結合を表す線の太さや色の設定は[Objects]-[Properties]-[General…]-[Bonds]で行える。